Upptäckten av tre mänskliga gravar i kyrkan i Alamo i San Antonio har gjort en tvist om indianernas närvaro på den historiska platsen.
Kropparna verkar vara en tonåring eller ung vuxen, en stor vuxen och ett spädbarn, sade myndigheterna.
Delstaten Texas och staden San Antonio befinner sig i ett tidigt skede av en plan på 450 miljoner dollar för att bygga om den historiska platsen. En arkeologisk undersökning av Alamo Plaza, stadsområdet som omger Alamos historiska byggnader, har redan slutförts, rapporterade San Antonio Express-News.
Webbplatsen är känd för slaget vid Alamo 1836, då färre än 200 "texianska" försvarare - inklusive Jim Bowie och Davy Crockett - höll på i 13 dagar i strid med nästan 2 000 mexikanska soldater.
Trots att texianerna förlorade och de flesta av försvararna dödades blev "Kom ihåg Alamo" ett stridsrop och belägringen ledde till att Texas blev en del av USA 1846.
Men motståndare till ombyggnadsplanen, inklusive vissa indianergrupper, hävdar att den inte tar tillräckligt med hänsyn till den historiska betydelsen av Alamo före belägringen 1836. Denna tvist har lett till rättsliga åtgärder och det har nu förvärrats av upptäckten av kropparna, som kan vara indianer, upptäckt vid Alamo-kyrkan.
Planens motståndare säger att Alamos begravningsplats bör utredas först och att minnesmärken på platsen bör betona dess 150 års historia före 1836.
"Att genomföra en fullständig arkeologisk undersökning borde vara en del av detta projekt," sade Gabriel Velasquez, en medlem av San Antonio's Historic Design and Review Commission, som har röstat emot delar av ombyggnadsplanen.
Tre Alamo-gravar
Arkeologer hittade gravarna som innehöll de tre kropparna i naturen och vad som kallas Monks Burial Room inuti Alamo-kyrkan, enligt ett uttalande från Texas General Land Office (GLO).
GLO, en byrå i delstaten Texas, äger kyrkan och byggnaden "Long Barracks" på platsen - de enda två strukturer som har överlevt, nästan intakt, sedan belägringen 1836.
Men på 1700-talet var Alamo ett spanskt uppdrag känt som Misión San Antonio de Valero, byggt för utbildning av lokala indianer efter deras omvandling till romersk-katolisismen.
Webbplatsen användes också som en begravningsplats för upp till 1 300 människor - främst inhemska - som enligt vissa indianergrupper hade konverterat till kristendomen.
Kropparna hittades under arbetet med att installera fuktövervakningsutrustning inuti kyrkan och för att lokalisera och dokumentera grunden för de 300 år gamla strukturerna, enligt GLO-uttalandet.
Som svar på upptäckten stoppades utgrävningarna av gravplatserna medan ett "länge etablerat protokoll" för att skydda de mänskliga resterna aktiverades, säger uttalandet.
Det är inte första gången mänskliga gravar hittas på Alamo-platsen. Vissa rester hittades i kyrkan 1989 och 1995, och fler mänskliga rester tros vara inblandade där.
Kom ihåg Alamo
Tjänstemän från Alamo Trust, som administrerar webbplatsen för Texas General Land Office, vägrade att prata med Live Science om upptäckten av kropparna.
Men en talesman för GLO berättade för New York Times att förfaranden på plats för upptäckten av mänskliga kroppar på platsen följdes korrekt. "GLO har länge erkänt Alamo som en begravningsplats och kommer att se till att denna historia berättas i det framtida museet," sade talesman Karina Erickson.
Många människor som motsätter sig den nuvarande planen för ombyggnad av staden och staten för Alamo hävdar att den förhärligar händelserna 1836 på bekostnad av den tidigare användningen av uppdragsbyggnaden - som centrum för ett tidigt kristen samhälle och en begravningsplats för indianers konvertiter .
Stadskommissionären Velasquez sa att protokollet för att hantera mänskliga rester på Alamo-platsen endast behandlar dem som upptäckter av enskilda gravar och inte som delar av en större gravplats.
"Om vi har att göra med en kyrkogård, är det obetydligt för oss att hantera den med denna 'hittade allvarliga' filosofi," sa Velasquez till Live Science.
Medan slaget vid Alamo 1836 förtjänade att minnas, "... under den historien är en markör för omvandlingen av indianerna i detta område av landet, om inte landet som helhet," sade Velasquez.
Tills en fullständig arkeologisk undersökning av hela Alamo-platsen genomförs kommer ännu fler mänskliga rester att finnas där, sade han.
"Det fortsätter att hända och det kommer att fortsätta att hända om vi behandlar alla dessa rester som om de inte ingår i en gemenskap av de döda," sade han. "Dessa är inte relaterade begravningar."
